飛騨の「h」と養護の「y」を組み合わせたフォルムで表されており、大空ではばたく、児童・生徒の心意気を表しています。 校名は、飛驒養護学校から飛驒特別支援学校に改称しましたが、この交校章は長年親しまれてきたものなので、継続して使用しています。
