平成25年4月に開校した本校では、12月7日開催の湯ヶ峰フェスタ(学校祭)において
校章と校歌の披露がなされました。
飛騨地区の高等学校と特別支援学校高等部生徒に校章デザインの依頼をしたところ、２０５作品の応募がありました。児童生徒や保護者の意見を伺いながら、職員の意見も交えて検討に検討を重ねて、ここに掲載してある校章のデザインとなりました。

小学部・中学部・高等部の児童生徒が仲良く楽しく学校生活をおくっている様子を描いています。
“G”は下呂特別支援学校のイニシャルで、緑色は自然と安全な学校を表しています。